Mühlhausen (ufficialmente Mühlhausen/Thüringen) è una città dello stato federale della Turingia, in Germania. È la capitale del distretto di Unstrut-Hainich, e sorge lungo il fiume Unstrut. Mühlhausen nel 2005 contava 37.480 abitanti. Mühlhausen in Turingia fu menzionata per la prima volta nel 967 come villaggio del Palatinato ottoniano, ma ebbe il suo periodo di gloria dal XIII al XV secolo. Nella Chiesa di Santa Maria il riformatore radicale Thomas Müntzer predicò le sue teorie nel 1525. Johann Sebastian Bach fu organista nella chiesa Divi Blasi dal 1708 al 1709. Dal 1944 al marzo 1945 l'amministrazione di Buchenwald aprì un sottocampo per le donne direttamente al di fuori di Mühlhausen. Le donne del piccolo campo di concentramento dovevano lavorare in condizioni brutali in cambio di pochissimo cibo; tutte le persone internate furono poi trasportate nell'aprile 1945 a Bergen Belsen.